乳腺囊肿多继发于乳腺囊性增生，常见于30岁到50岁的妇女。患者有乳腺组织的增生，并且在结构、数量和组织形态方面存在异常。

患者常常有卵巢功能的失调。正常情况下在一个月经周期内乳腺组织会增生和复旧。而乳腺囊肿患者因为体内激素水平失调，雌激素激素水平增高，与黄体酮比例失调，使乳腺复旧不全。患者乳腺增生，增生组织见可见很多散在的小囊，这些囊是囊状扩张的乳腺导管。这些囊壁大多光滑，内含黄绿色或者棕色粘稠液体。有的时候，会有黄白色奶酪一样的物质从乳管口溢出来。

乳腺囊肿患者中一部分患者经常生气。经常生气郁闷会干扰体内激素水平，从而加重囊性增生。对于这部分患者，可以用中药梳感理气，从而达到减轻增生缓解疼痛的目的。

经常熬夜和劳累也可以诱发乳腺囊肿。人体的激素分泌受自身生物钟调节的。如果经常熬夜和劳累，身体的生物钟会紊乱。当体内激素水平增高或者高水平激素持续时间过久时，便可能形成乳腺囊肿。对于这部分患者，应当尽量按时作息，适当休息，降低工作强度。大部分患者通过调节睡眠和休息，乳腺囊肿能够得到缓解。

长期服用避孕药也可以导致乳腺囊肿。避孕药成分作用跟雌激素是一样的，避孕药的原理是通过外源性摄入雌激素达到感染月经周期，从而达到抑制排卵的作用。因此长期服用避孕药也可以引起乳腺囊肿。