自然流产患者孕囊多久会排出，这是因人而异的，也有一部分的人在怀孕，40天左右孕囊就自动排出来了，也有的人是在比较晚的时间才胚胎停育，有的是在怀孕七八十天的时间之后才会排出孕囊，甚至有的人需要更久的时间。有的人会是胚胎停育后，很短的时间就自然排出来了，也有的人检查到稽留流产很久的时间都没有出血，都没有排出孕囊。

自然流产，有的孕囊会很顺利很完整的排出来的，有的人是刚刚检查的，怀孕或者刚刚有出血就已经排出来了。但是也有很多人孕囊组织会比较长时间的滞留，或者有的自然流产会出现部分组织排出，会有不全流产，导致随时大出血的可能性的。

检查到胚胎已经停止发育的情况，是不能等待自然流产的，因为不积极的处理而等待，不仅是会发生不全流产，出血过多的可能，也有的会因为比较长时间的少量的阴道出血而导致炎症的可能性，也有的会因为不发育的胚胎组织，影响到凝血功能，导致一些高凝的物质进入体内，也有的人就会出现凝血功能障碍出现弥漫性血管内凝血的可能性。所以如果已经明确胚胎停止发育，是要积极的做血常规，凝血功能，肝肾功能等等的检查的，是需要积极的终止妊娠才可以的，有炎症的人群也是要尽早的先做消炎治疗，以预防流产导致炎症扩散的可能。然后根据检查到的孕囊组织和出血的情况，等等来决定选择药物流产或者是做清宫手术。