扁平疣是由人乳头瘤病毒感染所引起的一种皮肤传染性疾病，临床主要表现为颜面部、手背部的疣状病变，大多没有明显的不适感，少部分伴有一定的瘙痒感，疾病具有一定的自限性，扁平疣容易和其他的一些疾病相混淆，要注意加以鉴别。

首先人乳头瘤病毒是一种常见的致病性病毒，可以分为多种不同的型别，感染以后可以造成全身多部位的皮肤粘膜的病变，表现为不同的疾病类型，要注意加以鉴别。

首先应该和人乳头瘤病毒感染所引起的其他的一些疣状疾病进行鉴别，比如寻常疣、尖锐湿疣、口腔疣、跖疣等，分别由人乳头瘤病毒的不同型别感染所致，并且疾病所发生的部位是不一样的。如果要进行确切的鉴别，除了临床表现和病史以外，还可以从致病病原体的检测来进行鉴别，致病病原体也就是人乳头瘤病毒型别的鉴定是鉴别的金标准。

其次应该和其他的皮肤结节性疾病相鉴别。比如汗管瘤，是一种先天性的汗管发育异常性疾病，对身体没有特殊的危害性，也不具有传染性。两者在皮肤的颜色形态上存在的一些差别性，汗管瘤的颜色和皮肤的颜色一致，并且生长比较缓慢。在进行皮肤搔抓时，扁平疣可以出现眼皮肤的播散，而汗管瘤不会有此表现。如果能进行局部皮疹的病理学检查，是鉴别的最准确方式。

另外还要和一些皮肤疱疹性疾病相鉴别，疱疹性疾病比较常见的是单纯疱疹病毒感染所出现的皮肤病变，通常没有特殊的临床症状，皮疹大多呈现水泡状疱疹，病毒学检测是鉴别的标准。