脑炎是一大类疾病，根据有无感染因素参与其中，大致可分为感染性因素所致脑炎和非感染性因素所致脑炎。感染性因素所致脑炎又分为细菌感染、病毒感染、真菌感染、寄生虫感染、螺旋体感染、其他病原体感染等几类。

非感染性因素所致脑炎主要指自身免疫性脑炎。主要检查的项目有头颅MRI（必要时需要增强）、腰椎穿刺、脑电图、一些特异性的脑炎抗体等。

头颅MRI：又叫头颅核磁共振，是一种无创伤性的检查，主要目的是了解脑细胞有无受损，以及受损的部位、程度等，因为很多疾病的头颅MRI表现相近，而脑炎本身的病因又非常复杂，有时为了更好的与其他疾病相鉴别，就需要做增强头颅MRI，所谓增强的意思，就是除了普通的头颅MRI以外，还需要向血管内注射一种显影剂，看病灶有无强化现象，借以鉴别。有些复杂的脑炎，可能还需要反复多次做头颅MRI，以便动态观察和对比（比如治疗前和治疗后）。

腰椎穿刺：这个是检查脑炎的常规操作，以前有些不了解的老百姓称之为“抽脊髓”，实际上理解是错误的。这个腰椎穿刺，抽的不是脊髓，而是围绕在脊髓表现的“水”，叫脑脊液，这个是人体内循环产生的，就好比尿液一样，所以有些误解的老百姓认为腰椎穿刺后会变傻是错误的，抽脑脊液的目的主要是通过脑脊液成分的变化鉴别脑炎的病因。

脑电图：辅助判断有无异常脑电波发放。

特异性的脑炎抗体：主要是鉴别自身免疫性脑炎。

当然，脑炎的病因是极其复杂的，以上只是列出了最精要的几个项目，实际临床工作中还需要根据患者病情加做一些其他项目。