慢性肠炎可分为六大类型，分别是：

1、病毒性肠炎：犬瘟热病毒、犬细小病毒、犬猫冠状病毒等可以引起肠炎，轮状病毒可以引起婴幼儿腹泻，诺瓦克病毒则可以引起成人和儿童的流行性病毒性胃肠炎。

2、细菌性肠炎： 痢疾杆菌、空肠弯曲菌和沙门菌等细菌可以引起细菌性肠炎。

3、真菌性肠炎：组织胞浆菌、曲霉菌、藻状菌和白色念珠菌等可以引起真菌性肠炎，以白色念珠菌最多见。

4、寄生虫性肠炎： 蛔虫、弓形虫、钩虫、阿米巴、鞭毛虫和球虫等可以引起寄生虫性肠炎，以溶组织内阿米巴最常见。

5、饮食所致的肠炎： 污染或者腐败食物、刺激性化学物品、变态反应和重金属中毒等都能引起肠炎。

6、抗生素导致的肠炎：临床上滥用抗生素，可以导致肠道的菌群失调，或者耐抗生素菌株出现而产生肠炎。

慢性肠炎的治疗可分为病原学治疗和对症治疗。1、病原学治疗：病毒性肠炎一般来说无需病原治疗，常可自愈；细菌性肠炎根据细菌药敏试验选用抗菌药，一般可选用氟哌酸、庆大霉素和丁胺卡那霉素等；白色念珠菌肠炎以制霉菌素口服或者应用二性霉素B治疗；寄生虫肠炎可选择相对应的驱虫药物进行治疗。

2、对症治疗：补充液体，纠正电解质和酸碱平衡紊乱。轻度脱水可口服补液盐，脱水严重者，可静脉输入生理盐水、林格氏液、氯化钾溶液和葡萄糖溶液。