胚胎停育病因复杂，主要包括遗传因素、解剖因素、内分泌因素、感染因素、血栓前状态和免疫紊乱。

近年来生殖免疫研究表明，胚胎停育的病因约有50-60%与免疫紊乱有关，包括封闭抗体产生不足，抗磷脂抗体形成、组织非特异性抗体（例如抗核抗体、抗DNA抗体）的形成，组织特异性抗体（例如抗精子抗体、抗子宫内膜抗体等）的形成以及NK细胞[CD56+和（或）CD19+]数量增加或活性升高等。

抗磷脂抗体是一组自身免疫性抗体，包括狼疮抗凝因子、抗心磷脂抗体、抗磷脂酰丝氨酸抗体、抗磷脂酸抗体等。抗磷脂抗体阳性者发生复发性流产的几率高达66-89%。

对于抗核抗体阳性者，还需要进一步检查抗ENA抗体、抗ds-DNA 抗体等；抗贝塔2-GP1抗体阳性者，将减低抗贝塔2-GP1对带阴性电荷磷脂所催化的凝血反应原有的移植作用，形成血栓前状态，导致胎盘缺陷引起流产；

自然杀伤细胞（NK）：是固有免疫系统中十分重要的一类淋巴细胞，占淋巴细胞总数的15%，通过发挥细胞毒性作用和分泌细胞因子，在机体抗感染、抗肿瘤、免疫调节等方面起重要作用。NK细胞在正常未孕的子宫内膜存在，同时也是妊娠后子宫内膜中增加最为明显的免疫职能细胞。有研究发现子宫蜕膜中CD16+NK细胞比例增高可以导致胚胎死亡。

所以胚胎停育上述免疫检查是必要的。