口腔溃疡应该与创伤性溃疡，结核性溃疡，坏死性涎腺化生和癌性溃疡相鉴别。

MaRAU多发生于青春期，溃疡特征表现为大，好像一个深坑，可达黏膜下层腺体及周围组织。直径大于1cm，边缘充血不齐形成假膜。一般发生口腔后部，全身状况较好有自限性。

创伤性溃疡多发于青少年，一般好发于口腔唇、颊、舌颊脂垫。一般是机械性刺激、化学性灼伤和热冷刺激伤所导致。一般表现为上皮连续性破坏，深浅不一，边缘可隆起形态与损伤因素相关。后期可见肉芽组织增生。病理表现为慢性炎症。全身状况好，没有自限性。首先应去除刺激因素是首要治疗。

结核性溃疡多发于中青年。细胞好发部位于唇，前庭沟和牙槽黏膜。表现为溃疡周围轻度浸润。呈鼠噬状，底部肉眼可见肉芽组织。病理分析胃朗格汉斯巨噬细胞。全身状况不好表现为肺结核体征，没有自限性。

坏死性涎腺化生一般多发生于男性，女性少见。溃疡破坏组织比较大，可达到骨面，溃疡边缘有隆起，凹凸不平，底部可见柔雅组织。边缘易充血。一般多发于硬腭以及软硬腭的交界处。病理表现为小涎腺坏死。患者表现弱或者较好。有自发性和自限性。

癌性溃疡多发于老年人。一般发生于舌腹舌缘，口角区，软腭复合体。溃疡表现深浅不一，溃疡边缘不齐，底部可见菜花状。病理表现细胞癌变，患者全身状况索过恶病质。没有自限性。