当子宫内膜上皮细胞及腺体出现在子宫体以外的部位，即为子宫内膜异位症，异位子宫内膜随卵巢激素变化而发生周期性出血，导致周围纤维组织增生和囊肿、粘连形成，在病变区出现紫褐色斑点或小泡，最终发展为大小不等的紫褐色实质性结节或包块。其中最易被侵犯的部位为卵巢，因囊肿内潴留的陈旧血瘀如巧克力糊状的颜色，称为卵巢巧克力囊肿，80%病变累及一侧卵巢，50%累及双侧卵巢。  

(1)痛经和下腹痛是主要的临床症状。继发性痛经，进行性加重，是典型的疼痛症状。异位的子宫内膜受卵巢激素的作用，发生周期性的增生，分泌的变化。疼痛位置多位于下腹。

(2)性交不适，多见于直肠子宫陷凹有异位病灶或者局部粘连，均可发生性交痛，而且常于月经前较为明显。

(3)不孕 发生率为40%左右， 引起不孕的原因复杂，如盆腔微环境改变影响患者常因盆腔器官粘连，使输卵管蠕动受阻或输卵管堵塞等机械因素导致不孕症的发生，并可能改变自身免疫反映应，导致胚胎着床的异常。

(4)月经不调 百分之15到30患者会出现月经增多，经期延长，月经淋漓不尽或者经前期点滴出血。