小儿手足口病所使用的药物主要以抗病原体药物以及对症支持治疗药物等。

小儿手足口病是一种常见的急性病毒传染性疾病，致病病原体是一组肠道病毒，包括的种类比较多，比如常见的科萨奇病毒a组16型，肠道病毒71型，尤其是后者，可以导致一些重症病例，在每年的夏秋季节高发，以学龄前儿童为高发人群，临床特征性的表现主要是手、足、口腔等部位皮肤粘膜的皮疹、疱疹、溃疡等，少部分病例可以出现一些严重的并发症，所以应该及时的诊断，及时的进行相应的治疗。

早期诊断，及时的进行抗病原体治疗，主要是一些抗病毒的药物，虽然目前还缺乏特异、高效的抗病毒药物，但是可以选择利巴韦林进行治疗，儿童按照体重每天10~15毫克每公斤体重，分4次口服，疗程5~7天。另外可以使用一些清热解毒方面的中成药，比如小儿牛黄清心散之类的药物，可以有一定的抗病原体，减轻病情，缩短病程，减少重症病例的发生的作用。

另外是使用一些对症支持方面的药物，如果持续的高热，除了物理降温以外，可以使用一些解热止痛的药物，比如布洛芬混悬液等。如果出现咳嗽、咳痰的症状，可以使用一些镇咳祛痰的药物，比如沐舒坦片等。同时要注意保护心、脑、肺等重要脏器的功能。

经过及时的治疗以后，绝大多数的手足口病患者预后良好，病死率低于1%，有中枢神经系统、心脏方面的并发症的重症病例是导致死亡的高危人群。