巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种。子宫内膜异位症发病的原因到目前为止还是不太清楚的，属于激素依赖性疾病，与雌激素水平是有关系的，比如多次的宫腔操作，包括人工流产，带节育环，取节育环等等，这样就容易导致子宫内膜异位症的发生，和自身的体质关系不是很大的。