淋球菌性结膜炎出现青霉素耐药菌，因此药物敏感实验非常重要，在药物敏感实验没有出来之前可以给予广谱抗生素，妥布霉素滴眼液或左氧氟沙星滴眼液。 此病发展迅速，结膜充血水肿，伴有大量脓性分泌物，患者迅速引起角膜混浊，浸润周边或中央角膜溃疡治疗不及时，几天后可发生角膜穿孔，严重威胁视力分泌物较多时可用冲洗剂3%硼酸水或生理盐水冲洗结膜囊。全身积极应用主要的抗生素肌注或静脉给药，头孢曲松钠、喹诺酮类环丙沙星、氧氟沙星，用青霉素肌注或静滴，要积极治疗。