太田胃散对于幽门螺旋杆菌的治疗没有多大意义，幽门螺旋杆菌治疗需要选择三联或四联方案才能够根治。 其中，三联抗幽门螺旋杆菌治疗成功率在百分之五六十，四联抗幽门螺旋杆菌治疗成功率在百分之七八十，首选四联方案。通过一种质子泵抑制剂和两种抗生素，加一种铋剂，规范用药两周，从而根治幽门螺旋杆菌。需要停药四周后复查碳呼气试验，必要时需要间隔2至3个月，再次抗幽门螺旋杆菌治疗。如果治疗反复失败，需要通过药敏试验来指导抗生素使用，以提高成功率。