巧克力囊肿在临床上，如果直径在5到6厘米左右，就有可能发生破裂的现象。 巧克力囊肿在临床上，一旦确诊建议尽快手术治疗，因为一旦巧克力囊肿出现破裂，后果不堪设想，因为囊液内的子宫内膜碎片会流到盆腔或者腹腔内的任何位置，有可能会种植在盆腔或者腹腔内的脏器上，引起新的子宫内膜异位病灶，所以，对于巧克力囊肿建议尽快给予手术治疗，在术后囊肿有可能会出现复发的情况，建议可以用达菲林这样gnrh的药物给予治疗，或者抑那通给予治疗，主要是预防复发的可能性，在术后积极复查。女性在患有巧克力囊肿时常常可能会出现进行性加重痛经，而且还会继发性的不孕，如果巧克力囊肿增大明显，在体位改变或者剧烈运动时就有可能出现巧囊的破裂。