无论男性还是女性的肾囊肿的病因主要有分两种，一种单纯性的肾囊肿，主要是表现为双肾散在的一些囊肿，如果不是特别大超过5厘米不需要处理。另外一种是基因异常所导致的多囊肾多囊肝综合征，分为常染色体隐性遗传的，早年婴幼儿发病的，死亡率比较高的一种类型和常染色体显性遗传的，中老年以后逐渐发病，并最终表现为肾衰衰竭的，另一种类型。其根本原因都是，肾小球以及肾小管的病变，表现为肾小管的异常的扩张增生，肾小球上皮细胞的增殖异常，还有间质细胞的异常增生所导致的囊性的病变。逐渐扩大之后，肾小球肾皮质逐渐萎缩，肾功能的逐渐失代偿，最终表现为尿毒症。