多数甲状腺疼和喉咙痛靠疼痛位置即可区分，但是亚急性甲状腺炎痛与喉咙痛比较难区分。各种因素刺激甲状腺而引起甲状腺病变，从而引起的疼痛，此时一般在喉结的两侧，并在触摸时疼痛较为严重。 而喉咙痛的原因主要是患有上呼吸道感染、上火以及扁桃体发炎等疾病所导致，此时的疼痛多处于咽喉壁，并还会表现为喉咙干痒和吞咽有异物感等症状。亚急性甲状腺炎通常表现为颈部前方皮肤疼痛，有时会出现皮肤隆起和压痛，与喉咙痛很难鉴别，只有进行血常规、血沉、甲状腺功能和甲状腺超声等检查，才可以准确有效地区分亚急性甲状腺炎和咽喉炎导致的喉咙痛。