怀孕40天自然流产对身体的伤害，通常情况下是不太大的。 这是因为怀孕40天一般来说孕囊偏小，发生自然流产之后，机体的损伤也不大。但是，在发生自然流产后，需要及时的到医院进行相应的检查。通过B超等检查，确认宫腔内是否还有残留物质，并根据检查的情况选择合适的治疗方案。在流产之后要多注意休息和保暖，避免劳累或者着凉，不做剧烈运动，观察阴道出血的情况。饮食上不吃生冷及辛辣刺激的食物。在流产后的一个月之内禁止同房或是盆浴，以免感染炎症发生。