子宫内膜异位囊肿的患者，也是能够生育。子宫内膜异位囊肿是子宫内膜异位症的一种表现，内异症患者的生育能力有不同程度的下降，内异症越严重，生育能力越低。内异症的患者不孕率高达40%，引起不孕的原因比较复杂，比如盆腔微环境改变，影响精卵结合及运送。免疫功能异常导致子宫内膜抗体增加而破坏子宫内膜的容受性，卵巢功能异常导致排卵障碍和黄体功能不足等等。另外，中重度的内异症卵巢输卵管周围粘连影响受精卵的运输，这些都是导致不孕症的原因。