因为房颤病人的栓塞的发生率比较高，因此房颤病人要进行抗凝治疗。 华法林是房颤抗凝治疗的有效药物，使用华法林后使凝血酶原国际标准化比值INR维持在2.0到3.0，能安全而有效的预防脑卒中的发生。房颤持续不超过24小时，复律前无需做抗凝治疗，否则应在复律前接受华法林有效抗凝治疗3周，待复律成功后后继续治疗3到4周。或者进行食管超声心动图除外心房血栓后再进行复律，复律成功后仍需华法林有效抗凝治疗4周。紧急复律治疗可选用肝素或低分子肝素抗凝，新型口服药物如达比加群、立伐沙班，目前主要用于非瓣膜性房颤的抗凝治疗。