目前艾滋病阻断药的副作用比较少，比较常见的有消化道不良反应，比如恶心，呕吐，腹痛，腹胀等，神经系统不良反应有头晕，走路不稳，失眠，精神萎靡等，还可以导致肝肾毒性，但是这些副作用都是可逆的，当停用艾滋病阻断药后，副作用也会随之消失。