慢性鼻窦炎手术目前最常用的是功能性鼻内镜手术，该手术目的是把传统的根治性手术，也就是破坏性手术改进为功能性手术，也就是重建性手术，从而彻底治愈鼻窦炎并恢复其原有功能。按照鼻腔呼吸气流的特点，气流进入鼻腔后，首先冲击中鼻甲、中鼻道和前组筛窦，因此该区域最容易受到感染和变应原的攻击。现代理论认为筛窦发病率最高，而且也是其他各窦发病的源点。功能性鼻内镜手术的重点是筛窦手术，过去认为不可逆的上颌窦、额窦和蝶窦炎症，若行手术清除前组筛窦病灶，恢复其正常鼻窦通气及引流功能，其他各鼻窦炎症也可逐渐消退，不需另行手术。