非淋菌性尿道炎与淋病的区别为，非淋菌性尿道炎是由链球菌以外的病原体感染引起的尿道炎，而淋病是由淋病奈瑟菌感染引起的泌尿生殖系统化脓性感染。另外两者的潜伏期不同，非淋菌性尿道炎的潜伏期一般为一到三周，而淋病的潜伏期一般为三到五天。在症状上，非淋菌性尿道炎症状相对较轻，表现为尿道的刺激，症状有刺痒、刺痛，尿道分泌物增多，呈白色稀薄状液体，女性常无症状。而淋病的症状相对较重，表现为尿道的刺激症状，可伴有尿痛和排尿困难，尿道口有白色脓性分泌物。