幽门螺旋杆菌感染可能会使浅表性胃炎进展为糜烂性胃炎，胃溃疡甚至胃癌的可能，所以发现幽门螺旋杆菌阳性后。 如果有临床恶心，反酸，烧心，腹痛等症状通常需要进行干预的。目前标准化治疗为四种药，口服14天的疗程。服药期间忌烟酒，服药要规律，疗程结束后停药一个月，消化科复查碳13或碳14呼气实验，观察幽门螺旋杆菌有没有被完全杀灭。 高龄患者没有明显临床不适症状的幽门螺旋杆菌感染者不推荐进行杀菌治疗。另外部分幽门螺旋杆菌阳性患者一次抗菌治疗未能成功杀菌，第二次需要更换方案进行标准治疗，同样需要治疗后停药一月复查呼气试验，观察疗效。