早起偏头疼可以见于原发性的偏头痛，可以是多种外在非特异性的因素所诱发，包括夜间睡眠时受寒着凉、情绪压抑、睡眠不足或睡眠过多、夜间不通风的环境、女性生理期激素水平变化等都可以诱发。另外有些患者造成偏侧的头疼，还可能和感冒等在内的炎症感染因素有关。有的患者则是存在颈椎病等颈椎疾患，夜间睡眠时枕头不当或者颈枕部有受寒着凉的情况，都有可能会导致偏侧出现头疼，要注意留意有无上述提到的原发病及可能的诱因。颅内疾患单纯的引起偏侧头痛是较少见的，而且通常除头疼之外，颅内疾患可有其他的神经功能缺损症状存在。