巧克力囊肿不会引起发胖。巧克力囊肿一般表现痛经或影响怀孕。发胖可能是月经不调引起的，如多囊卵巢综合症，多囊卵巢综合症表现月经周期长，体重短期内增长较快。如果没有月经周期长就不考虑多囊卵巢综合症，发胖可能与饮食或生活不规律或工作压力大有关系。