做脑电图不一定能够查出头痛的原因，头痛原因非常多，甚至很多并不是颅内的原因所致。 包括脑电图、颅脑CT或磁共振等检查都不一定能够发现异常。比如一些非特异性的头痛，如偏头痛、丛集性头痛、紧张型头痛的患者都是没有相应的病灶的，其诊断主要根据患者主要的临床表现、诱发因素、头痛特点来帮助鉴别。很多头痛是由于五官科的部分疾患如鼻窦炎、青光眼所导致的，做脑电图也不会有异常。脑电图主要是用于癫痫的诊断，可能会发现一部分异常的癫痫波形，而对头痛并无特异性。有些脑炎的患者或者中毒性脑病等患者，脑电图可能也会有异常，但这些患者的症状并不只是头痛。所以一般并不只是通过脑电图来查找头痛的原因。