卵巢巧克力囊肿打了三针，是否还要继续打，取决于患者的年龄，还有没有生育要求以及巧克力囊肿的大小，治疗后复查囊肿变化的情况来综合评估。巧克力囊肿是子宫内膜异位囊肿其中的一种表现。用药物治疗打针一般是使用的亮丙瑞林、曲普瑞林、戈舍瑞林这一类药物。通过抑制体内下丘脑和卵巢分泌性腺激素，抑制雌激素的分泌，达到假绝经的目的。短时间内不来月经小的子宫内膜病灶会坏死，巧克力囊肿会萎缩变小。一般来说，对于有生育要求的，一般打3到4针。而年龄较大，没有生育要求的，一般注射六针。