孩子身材矮小的原因有很多，不同疾病的治疗方法不同，常见的原因包括以下三个方面。一，营养问题。二，内分泌问题。三，其他慢性疾病。营养问题主要见于孩子偏食、挑食以及胃肠道一些疾病导致消化吸收不良，引起营养缺乏导致的身材矮小。内分泌问题常见于生长激素缺乏或性腺发育不良。如果是由于生长激素缺乏引起的身材矮小，也就是我们常说的侏儒症，可以注射生长激素，使孩子达到一个正常人的身高。如果是其他的内分泌系统疾病，如甲减导致的呆小症，则需要口服甲状腺激素来对应治疗。第三就是其他的一些慢性疾病，如一些慢性肝炎或者一些恶性肿瘤或者其他的慢性消耗性疾病，也会导致孩子出现身材矮小。