如果发现肛瘘自行消失了，有可能是肛瘘的外口愈合了导致没有看到肛瘘的，对于这种情况它只是表面上外口出现了愈合，其实肛瘘的内口和里边的瘘管还是没有愈合的，可能过一段时间炎症加重，肛瘘的外口又会出现肿胀破溃、流脓水的情况了，所以肛瘘如果仅仅是表面愈合，这并不能说明肛瘘已经好了，肛瘘还是存在的，对于肛瘘的治疗，保守治疗，用药等等，基本上没有什么太好的效果，最好的办法就是手术切除或者切开肛瘘来进行治疗，肛瘘如果不进行手术，拖的时间比较长有可能就变成复杂性肛瘘了。