巧克力囊肿4个厘米相对来说也是不严重的，需要定期做B超检查，观察囊肿增长的情况，但是需要提醒的是巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，子宫内膜异位症到目前为止原因还不是很清楚，但是属于激素依赖性的疾病，尤其和雌激素水平是有关系的，这个囊肿会不断的往大增长的，如果超过5个厘米了，而且痛经越来越加重了，这个时候就要手术进行治疗，这个手术不需要开刀的，可以选择腹腔镜进行手术治疗，腹腔镜是治疗子宫内膜异位症的金标准。