桉柠蒎肠溶胶囊的副作用比较少见，偶见有胃肠道反应和过敏反应，如皮疹瘙痒、面部浮肿、循环障碍和呼吸困难等，其为粘液溶解性祛痰剂，可改善气管粘膜纤毛的运动，促进腺体分泌粘液，并可以增加粘液的移动速度，促进痰液排出。