矮小症常见的原因有：生长激素分泌不足造成的，骨骼发育异常如软骨发育不全，先天性甲状腺功能减低引起的，染色体异常的导致的如先天性卵巢发育不全综合征，还有家族性身材矮小，没有查找到病因的特发性矮小症，其他内分泌代谢病异常引起的矮小。