肠套叠根据原因分为原发性和继发性，原发性即无明确病因，可能和婴儿回盲部系膜尚未完全固定，活动度较大有关。继发性的即有原因，比如麦克尔憩室、肠息肉影响。有些促发因素可以导致肠蠕动的节律发生紊乱，从而诱发肠套叠。比如饮食改变、腹泻等。