引起艾滋病的病原体为人免疫缺陷病毒，也叫做艾滋病病毒。艾滋病病毒属于一种变异性很强的病毒，根据艾滋病病毒基因的差异，目前将其分为HIV-1型、与HIV2型。其中，HIV-1型为包括我国在内的全球流行的主要毒株，具有较强的传染性和致病性。而HIV-2型传染性与致病性均比较低，主要局限于西欧、以及西部非洲等地。HIV-1型以及HIV-2型的氨基酸序列排列同源性大约在40%~60%之间。