小儿抽动症主要原因是遗传因素、神经生化因素、免疫因素、微量元素失衡、妊娠期异常、心理和环境等因素造成的。比如有抽动症家族史的孩子或抽动症较一般孩子几率要大。 小儿抽动症的发生与中枢神经递质多多巴胺、甲肾上腺素、氨基酸及五羟色胺调节失衡也有关系。免疫系统对病原菌如某些A型溶血性链球菌免疫应答过于活跃，也会导致此种疾病的发生。另外，如果身体中血铅浓度很高，血铅浓度过高，就会对脑、骨骼、肺存在明显异常，而出现对应的变化。还有，如果妊娠期，患儿母亲情绪不稳定，经常受到刺激，也容易导致孩子患此病。还有就是和心理环境因素有关，如果孩子的个人意愿被压制，或者出现强烈反抗情绪就会出现抽动，尤其出现忧伤、惊动、惊吓、紧张等精神影响时，或者刻意模仿别人形成动作反射，慢慢形成一种病态习惯。起初仅在某种刺激下发生，随着时间发展可变为习惯性的抽搐。