怀孕早期肚子疼有褐色分泌物，常见的原因有：宫外孕、胚胎停育、先兆流产、卵巢黄体囊肿扭转、子宫肌瘤变性等等。 怀孕早期出现褐色分泌物，也就是少量出血的表现，一般来说是子宫出血。而同时有肚子疼的情况，一定要先到医院的妇科门诊就诊，通过做B超检查，医生双合诊检查以及血HCG检查，综合分析判断是什么原因。考虑有先兆流产的，可以口服地屈孕酮或者肌注黄体酮注射液保胎治疗，而宫外孕是需要住院治疗的。如果检查结果提示是胚胎停育了，也要尽快的药流或者人流终止妊娠。有卵巢囊肿扭转的情况，属于急症，要做手术治疗。