原发性甲减是由于甲状腺腺体本身的病变而引起的甲减，一般占全部甲减的95%以上。 90%以上原发性甲减是由自身免疫性疾病，甲状腺手术或者是甲亢碘131治疗后所导致的，实验室检查血清促甲状腺激素水平增高，游离的甲状腺激素水平减低。 中枢性甲减是由下丘脑和垂体病变而引起的促甲状腺激素释放激素或者是促甲状腺激素分泌减少导致的甲减。其常见的病因多见于垂体外照射，或者是垂体肿瘤及产后大出血等。其中，由于下丘脑病变而引起的甲减，又称为三发性甲减，实验室检查血清促甲状腺激素减低或正常，总的甲状腺激素和游离的甲状腺激素减低，考虑中枢性甲减。