甲状舌骨囊肿是指在胎龄十周以前。有一部分胎儿会出现甲状舌管未退化或者消失不完全，这时就会引发甲状舌骨管囊肿的发生，通常在胚胎发育的第六周，甲状舌管就开始萎缩和退化，甲状舌管上段退化以后，起始段通常就会有出现一小块硬物，这种情况通常会经过一段时间自行消失，但是由于一些原因，在第十周以后，甲状舌管并没有完全消失和退化。还会在局部沉积留有囊肿，这种舌骨囊肿是先天形成的，而且是一种良性的改变。