女性有多囊是由于遗传基因和环境因素相互作用所导致的内分泌失调。 是由于下丘脑-垂体-卵巢轴的调节功能异常，从而使垂体对促性腺激素释放激素的敏感性增加，分泌过量的黄体生成素，刺激卵巢产生过量的雄激素，雄激素进一步会抑制卵泡成熟，不能形成优势的卵泡，使卵巢中的小卵泡长期处于分泌期状态，从而导致卵巢多囊样改变。除了内分泌失调以外，胰岛素抵抗和肾上腺内分泌功能的异常，也是导致女性有多囊的原因。