玻璃体切除术后最大的危害是会造成脉络膜及视网膜的复发性视网膜脱离以及脉络膜脱离，另外还会造成并发性白内障的产生。 当玻璃体切除术后一般会在玻璃体内进行三氟化碳气体或硅油的填充治疗。这种三氟化碳气体和硅油对前房以及前面的自我晶体产生一定的刺激作用，使自我晶体发生提前混浊，产生并发性白内障的临床危害，当发生并发性白内障时，视觉质量及视力也会有明显的丧失，所以需要联合人工晶体植入术，再进行二次手术治疗，所以玻璃体切除术后最大的危害，是继发的并发性白内障，另外，当玻璃体切除术后，由于三氟化氮气体和硅油是需要再次取出来的，容易发生再次的视网膜脱离以及脉络膜脱离，当发生再次视网膜脱离及脉络膜脱离时，容易形成脉络膜上腔出血。这也是玻璃体切除术后比较大的危害，需要在术后进行门诊随访观察，密切观察治疗。