脖子两侧有囊肿可能是因为皮下囊肿、脂肪瘤或者淋巴结等原因造成的，具体情况不明。诱因不一定是什么原因，有可能有磕碰受伤以后造成血肿机化，或者淋巴结增生甲状腺结节等相关疾病。具体脖子肿胀部位的原因，需要去医院做CT或者彩超进行查体检查，观察有无相关疾病。如果有淋巴结增生，可以再查一下血液指标，观察有无炎症、感染、肿瘤等问题。如果有甲状腺的囊肿，可以查一下甲状腺系列，观察有无甲亢等相关的疾病。