附件囊肿的病因是多方面的，首先是饮食和环境饮食，比如环境污染，电离辐射或者放射线等有毒有害物质，油炸或者辛辣刺激的食物以及被污染的食物；其次是外源性的激素补充，比如雌孕激素或者皮脂类固醇激素等过多的摄取；另外和感染也密切相关，特别是反复发作的盆腔炎性疾病，宫颈炎或者阴道炎，导致炎症的逆行感染；还有就是手术的创伤，比如子宫切除或者宫外孕的附件修补术，都会影响附件区的血液供应，导致局部的血流障碍，容易影响到内分泌功能和正常排卵，引起囊肿的发生。