多囊卵巢综合征会导致胚胎停育。 多囊卵巢综合征早期自然流产的发生率为百分之30到50%，是正常妇女的3倍，而其复发性早期流产发生率为百分之36到82%。多囊卵巢综合征的病人血清雌二醇和孕酮异常负反馈，导致垂体黄体生成素峰频率减少，引起卵泡发育成熟障碍。 另外高雄激素和高胰岛素可能通过直接损害卵子及早期胚胎造成流产，生长因子紊乱影响卵泡载体激素的合成影响卵泡正常发育使胚胎质量下降导致流产。孕酮和雌二醇比例失调，高雄激素，黄体生成素和促卵泡生成素比例失调，胰岛素抵抗与高胰岛素血症等字宫内膜增生异常和功能缺陷造成子宫内膜容受性下降或者子宫内膜发育与胚胎发育不同步，从而引起胚胎着床障碍和早期自然流产。