巧克力囊肿需要根据患者的具体情况，没有绝对的治愈方法，需要根据情况进行有针对性的治疗，目前可采用药物治疗，如口服避孕药，对较轻患者适用。孕酮治疗是通过使用高效孕激素导致假孕的发生。此外，还可进行手术治疗，包括保留生育功能、保留卵巢功能及根治术等。但有一种绝对的治愈方法。