大便的时候肚子疼，常常是由于肠道有器质性的病变引起的，例如有肠道的炎症息肉、肿瘤以及肠结核等相关的疾病。对于这种情况，建议患者一定要去医院及时的就诊，可以做结肠镜的检查、大便常规的检查、大便细菌培养的检查、大便寄生虫的检查、疼痛相关的检查，明确具体的病因。另外，在饮食方面也建议患者一定要有良好的生活习惯，不要吃辛辣刺激的食物，不要抽烟喝酒，不要吃生冷油腻的食物，不要吃隔夜变质的食物。另外，可以吃一些药物，及时缓解症状，例如可以应用肠道益生菌以及一些常用的解痉药物。