胎儿染色体异常大部分是在受孕过程中受到不良因素影响，比如药物、放射线、甲醛等等有毒有害物质等等导致的。这些不良因素可以使受精卵减数分裂发生异常，从而产生染色体异常。另外还有部分胎儿染色体异常，是从母亲和父亲遗传过来的，也就是说母亲和父亲的染色体存在异常，传递给胎儿的。