肛周脓肿和肛瘘是同一个疾病的两个不同的阶段。如果说哪个严重，在症状表现上来讲，肛周脓肿要更严重一些，肛周脓肿是肛周感染的急性发作期。这种急性感染会导致炎症反应，导致肛门周围的剧烈的疼痛或者发热，如果蔓延到更广泛的位置，会导致更严重的感染。而肛瘘是肛周感染形成的慢性期，主要是指肛门周围形成感染性的窦道，这种疾病不会像肛周脓肿，有那么明显的疼痛，但是会长期迁延不愈合。无论是肛周脓肿还是肛瘘这两个疾病最好的办法就是手术治疗，如果发现有这个疾病的表现，建议及时到医院就诊，明确诊断以便及时治疗。