屁眼肛门很疼，有很多方面的原因，比如有痔疮脱出、肿胀、水肿或者形成血栓有肛裂、有肛周脓肿、肛窦炎等等，这些都是有可能导致肛门疼痛，是比较常见的原因。当然，要想明确诊断。最好还是到医院去就诊，让医生实际检查一下就知道了。通过肛门检查和肛门镜检查，基本上可以确定大多数的肛门疾病。在明确诊断之后，采取针对性的治疗措施，能达到更好的治疗效果。对于这种情况一般可以先采用药物等保守治疗的措施来处理，比如口服消肿止痛的痔疮药物，肛门使用痔疮膏、痔疮栓等药物进行对症治疗，缓解症状，多数能好转和改善的。