两个小脚趾红肿多考虑以下几点方面原因。第一点，多考虑是长期干重体力活、运动过量、不正确姿势导致的运动劳损性改变，多考虑是无菌性炎症引起的酸胀痛。建议改善患者生活方式的同时加以热敷，必要时可给予非甾体消炎药、活血化瘀呀、局部理疗药物进行治疗，一般五到七天相关症状可以缓解，一般问题不大。第二个方面，多考虑是感染所导致的相关症状，建议行血炎症指标检查以及核磁共振检查来明确相关诊断，一般先以药物和改善患者生活方式进行治疗，看看相关症状是否缓解，必要时多考虑进行手术治疗。手术治疗的目的是将病灶清除，充分的引流，行细菌学培养以及药敏试验。根据药敏试验选用正确的抗菌药物抗感染治疗，一般问题不大。