自然流产宫外孕有包块的治疗方案需要根据宫外孕包块的大小，部位和血HCG数值的高低综合考虑。如果包块大于2厘米，血HCG数值持续升高，伴有腹痛和阴道流血，经过药物治疗无效的考虑手术治疗，或者有剧烈的腹痛伴有大出血征象的也需要立即手术治疗；相反如果包块小，血HCG数值较低，无明显的腹痛或者内出血的征象，可以采取期待治疗或者药物保守治疗，治疗过程中完善各项检查监测疾病的转归和调整治疗方案。