下午睡觉醒来会头痛的原因主要有以下几个方面：首先要考虑患者睡觉时间比较长，如果患者下午睡觉的时间非常长，此时，患者就处于快动眼睡眠期，如果患者在快动眼睡眠期苏醒过来，就有可能引起头痛，而且还可感觉全身乏力，不想活动。其次，要考虑偏头痛的可能，如果患者下午睡觉时间比较长，或者在睡觉的过程中出现了受凉，就可引起偏头痛急性发作，此时，就可引起患者表现为下午睡觉醒来会头痛，而且严重的患者还可出现恶心、呕吐。